Заведующая – Е.Э.Симсим Зоотехнический отдел был создан в 1960 году. Первым заведующим отделом был к.б.н. Ю.Л.Максимов, которого в 1964 году сменил С.С.Асанов. В 1980 году отделом заведовал д. вет. н. П.П.Вибе, а с 1982 по 1993 год – к.б.н. В.Г.Чалян, после перехода которого в Адлер (ГУ НИИМП РАМН) отдел возглавил д.б.н. проф. З.А.Джемилев, а с 2006 года Е.Э.Симсим.
Предпосылкой для создания отдела были фундаментальные исследования, проведенные лабораторией биологии, которая была организована в 1931 году П.В.Бочкаревым. Тематика лаборатории предусматривала решение многих научно-практических задач по изучению биологии разных видов обезьян. Все разработки и нормативы, полученные в лаборатории биологии, были учтены и использованы при составлении в 1960 году положения о зоотехническом отделе.
Сотрудники зоотехнического отдела занимаются решением производственных вопросов, связанных с организацией рационального содержания, кормления и разведения обезьян производственного стада. Для широкомасштабного разведения макак резусов и павианов гамадрилов, наиболее часто используемых в медико-биологических исследованиях, и обеспечения приматами выполнения различных научных программ к началу 80-х годов были созданы филиалы питомника в Адлере (заведующий – Р.В.Кебу) в Тамыше (заведующий – Ю.О.Оранский) и два заказника (Гумистинский и Туапсинский), где были выпущены павианы гамадрилы, привезенные из мест естественного обитания.
Главная научно-производственная задача отдела в послевоенные годы: создание нормальных условий жизнеобеспечения животных, поддержание их соматического здоровья, направленные на улучшение размножения и воспроизводства стада. Решение этой задачи осуществлялось продолжением изучения биологии размножения и закономерностей воспроизводства обезьян (З.А.Джемилев, Б.В.Нанба), вопросов питания и его влияния на соматическое состояние животных на основе биохимических исследований (З.Н.Джелиева).